Alpha Cell

Alpha Cell syftar till att skapa AI-baserade modeller för en holistisk, molekylär förståelse för den mänskliga cellens funktioner. Kunskapen om cellfunktioner som celldelning och metabolism är viktiga för ökad förståelse för olika sjukdomstillstånd.

Strategiska satsningar

Värdorganisation för projektet:
SciLifeLab och KTH

Beviljat anslag:
270 miljoner kronor

Alpha Cell bygger på den unika dataresursen Human Protein Atlas, HPA, där människans alla proteiner – som bygger och kontrollerar människokroppen – kartlades. Human Protein Atlas är med sina över 12 miljoner bilder som visar proteiners lokalisering på cellnivå en av världens mest utnyttjade biologiska databaser. HPA är Knut och Alice Wallenbergs Stiftelses största satsning på ett enskilt projekt, med ett sammanlagt anslag på närmare 1,1 miljarder kronor.

Utgångspunkten för Alpha Cell är att använda enkelcellsdata från HPA för att bygga cellmodeller. Dessa modeller kombinerar information från antikroppsbaserade data med information på molekylär nivå, data från cellinteraktioner och strukturprediktioner.

Alpha Cell kommer att kartlägga molekylerna på struktur- och funktionsnivå i tid och rum inuti cellen, och bland annat generera 3D-kartor med mycket hög upplösning av det molekylära maskineriet inuti celler och dess dynamik över tid. Detta gör forskarna med hjälp av ny teknologi inom ljus- och elektronmikroskopi. Teknikerna kommer att vara viktiga för att samla in kvantitativa data som krävs för att skapa en ny generation AI-baserade cellmodeller.